安布雷拉公司为军方研发生化武器，并在浣熊市地下设立了巨大的研究中心——蜂巢。然而，一次意外事故导致生化武器泄露，这种通过空气传播的病毒迅速扩散。负责蜂巢安保的超级电脑“红色女王”启动了应急措施，意外导致数百名工作人员丧命。四小时后，蜂巢安保人员爱丽丝（米拉·乔沃维奇饰）在蜂巢出口醒来，但由于催眠气体的影响失去了记忆。一支受命关闭红色女王的特种小队赶到，与爱丽丝、自称警察的安德森以及蜂巢工作人员帕克斯联手深入蜂巢的地下世界。随着任务的推进，他们接连遭遇红色女王的防卫系统和变异的丧尸袭击，而爱丽丝逐渐恢复的记忆揭示了她与这些同行者之间的不寻常联系。
